iTRAQ分析

iTRAQ(isobaric tags for relative andabsolute quantitation),即同位素相对标记与绝对定量技术。是指采用4种或8种同位素的标签，特异性标记多肽的氨基基团，然后进行串联质谱分析，可同时比较4种或8种不同样品中蛋白质的相对含量或绝对含量。通过生物信息学分析即可鉴定出所测蛋白及其在各样品中的表达差异。

实验流程

蛋白质提取-蛋白质定量-SDS-PAGE分离-酶解-ITRAQ标记-肽段分离-LC-MS/MS检测和数据采集-数据分析

蛋白鉴定结果：

1. 蛋白GO分类
   

2. 蛋白COG注释

3. 代谢通路分析
   

蛋白定量结果：

1. 差异蛋白GO富集分析
   

2. 差异蛋白代谢通路富集分析

3. 差异聚类分析
   

技术优势

√ 灵敏度较高：可检测出低丰度蛋白； 

√ 分离能力较强：可分离出酸/碱性蛋白，小于10KD或大于200KD的蛋白、难溶性蛋白等； 

√ 适用范围较广：可以对任何类型的蛋白质进行鉴定，包括膜蛋白、核蛋白和胞外蛋白等； 

√ 高通量：可同时对8个样本进行分析，特别适用于采用多种处理方式或来自多个处理时间的样本的差异蛋白分析； 

√ 结果可靠：定性与定量同步进行，同时给出每一个组分的相对表达水平、分子量和丰富的结构信息； 

√ 自动化程度较高：液质连用，自动化操作，分析速度比较快，分离效果好。